ARDB-Antibiotic Resistance Genes Database

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All genera that have antibiotic resistance genes identified are displayed in this toxonomy tree.
The number after the genus name indicates the number of antibiotic resistance genes identified in
this genus.

• Actinobacteria(442)
• Actinobacteria (class)(442)
• Actinomycetales(357)
• Actinomycetaceae(18)
• Arcanobacterium(14)
• Mobiluncus(4)
• Actinomycetales bacterium T2S067(1)
• Cellulomonadaceae(1)
• Oerskovia(1)
• Corynebacteriaceae(84)
• Corynebacterium(84)
• Dermabacteraceae(4)
• Brachybacterium(4)
• Microbacteriaceae(7)
• Leucobacter(1)
• Microbacterium(6)
• Micrococcaceae(4)
• Arthrobacter(3)
• Rothia(1)
• Micromonosporaceae(6)
• Micromonospora(6)
• Mycobacteriaceae(78)
• Mycobacterium(78)
• Nocardiaceae(2)
• Rhodococcus(2)
• Nocardioidaceae(2)
• Aeromicrobium(2)
• Promicromonosporaceae(1)
• Cellulosimicrobium(1)
• Propionibacteriaceae(1)
• Propionibacterium(1)
• Pseudonocardiaceae(7)
• Saccharopolyspora(7)
• Streptomycetaceae(137)
• Streptomyces(137)
• Streptomycineae(0)
• Thermomonosporaceae(2)
• Actinomadura(2)
• streptomycete ASSF17(2)
• Bifidobacteriales(79)
• Bifidobacteriaceae(79)
• Bifidobacterium(77)
• Gardnerella(2)
• Coriobacteriales(6)
• Coriobacteriaceae(6)
• Eggerthella(6)
• Aquificae(16)
• Aquificae (class)(16)
• Aquificales(16)
• Aquificaceae(7)
• Aquifex(3)
• Hydrogenivirga(4)
• Hydrogenothermaceae(9)
• Persephonella(2)
• Sulfurihydrogenibium(7)
• Ascomycota(5)
• Saccharomycetes(3)
• Saccharomycetales(3)
• Saccharomycetaceae(3)
• Kluyveromyces(1)
• Pichia(2)
• Sordariomycetes(2)
• Sordariales(2)
• Sordariaceae(2)
• Neurospora(2)
• Bacteroidetes(239)
• Bacteroidia(198)
• Bacteroidales(198)
• Bacteroidaceae(153)
• Bacteroides(153)
• Porphyromonadaceae(21)
• Parabacteroides(15)
• Porphyromonas(6)
• Prevotellaceae(24)
• Prevotella(24)
• Flavobacteria(35)
• Flavobacteriales(35)
• Flavobacteria bacterium BAL38(2)
• Flavobacteriaceae(33)
• Capnocytophaga(3)
• Chryseobacterium(7)
• Elizabethkingia(4)
• Flavobacterium(5)
• Riemerella(14)
• Sphingobacteria(6)
• Sphingobacteriales(6)
• Flexibacteraceae(1)
• Cytophaga(1)
• Sphingobacteriaceae(5)
• Pedobacter(2)
• Sphingobacterium(3)
• Chlamydiae(2)
• Chlamydiae (class)(2)
• Chlamydiales(2)
• Chlamydiaceae(2)
• Chlamydia(2)
• Chloroflexi(4)
• Chloroflexi (class)(4)
• Chloroflexales(4)
• Chloroflexaceae(4)
• Roseiflexus(4)
• Chordata(3)
• Actinopterygii(1)
• Tetraodontiformes(1)
• Tetraodontidae(1)
• Tetraodon(1)
• Mammalia(2)
• Primates(2)
• Hominidae(2)
• Homo(2)
• Deinococcus-Thermus(6)
• Deinococci(6)
• Deinococcales(6)
• Deinococcaceae(6)
• Deinococcus(6)
• Euryarchaeota(7)
• Methanobacteria(4)
• Methanobacteriales(4)
• Methanobacteriaceae(4)
• Methanobrevibacter(4)
• Methanococci(3)
• Methanococcales(3)
• Methanococcaceae(3)
• Methanococcus(3)
• Firmicutes(4617)
• Bacilli(4223)
• Bacillales(2316)
• Bacillaceae(1100)
• Anoxybacillus(3)
• Bacillus(1058)
• Geobacillus(36)
• Oceanobacillus(3)
• Exiguobacterium(5)
• Gemella(7)
• Listeriaceae(27)
• Listeria(27)
• Paenibacillaceae(26)
• Paenibacillus(26)
• Planococcaceae(8)
• Lysinibacillus(7)
• Sporosarcina(1)
• Staphylococcaceae(1143)
• Macrococcus(6)
• Staphylococcus(1137)
• Lactobacillales(1907)
• Aerococcaceae(5)
• Abiotrophia(4)
• Aerococcus(1)
• Carnobacteriaceae(5)
• Carnobacterium(2)
• Granulicatella(3)
• Enterococcaceae(592)
• Enterococcus(592)
• Lactobacillaceae(110)
• Lactobacillus(106)
• Pediococcus(4)
• Leuconostocaceae(3)
• Oenococcus(3)
• Streptococcaceae(1192)
• Lactococcus(44)
• Streptococcus(1148)
• Clostridia(383)
• Clostridiales(378)
• Blautia(12)
• Clostridiaceae(252)
• Clostridiaceae bacterium K10(3)
• Clostridium(249)
• Clostridiales Family XI. Incertae Sedis(13)
• Anaerococcus(10)
• Finegoldia(2)
• Helcococcus(1)
• Clostridiales bacterium 1_7_47_FAA(4)
• Epulopiscium(1)
• Eubacteriaceae(17)
• Eubacterium(17)
• Heliobacteriaceae(2)
• Heliobacterium(2)
• Lachnospiraceae(36)
• Anaerostipes(6)
• Butyrivibrio(3)
• Catonella(2)
• Coprococcus(6)
• Dorea(4)
• Roseburia(13)
• Shuttleworthia(2)
• Peptococcaceae(4)
• Desulfitobacterium(2)
• Desulfotomaculum(2)
• Ruminococcaceae(17)
• Anaerotruncus(2)
• Faecalibacterium(2)
• Ruminococcus(7)
• Subdoligranulum variabile DSM 15176(6)
• Veillonellaceae(20)
• Acidaminococcus(4)
• Megasphaera(7)
• Mitsuokella(2)
• Selenomonas(5)
• Thermosinus(2)
• Thermoanaerobacterales(5)
• Thermoanaerobacteraceae(5)
• Thermoanaerobacter(5)
• Erysipelotrichi(11)
• Erysipelotrichales(11)
• Erysipelotrichaceae(11)
• Clostridium ramosum DSM 1402(2)
• Clostridium spiroforme DSM 1552(2)
• Erysipelothrix(1)
• Eubacterium dolichum DSM 3991(4)
• Holdemania(2)
• Fusobacteria(16)
• Fusobacteria (class)(16)
• Fusobacteriales(16)
• Fusobacteriaceae(16)
• Fusobacterium(10)
• Leptotrichia(2)
• Sebaldella(2)
• Streptobacillus(2)
• Nematoda(4)
• Chromadorea(4)
• Spirurida(4)
• Onchocercidae(4)
• Brugia(4)
• Proteobacteria(12770)
• Alphaproteobacteria(201)
• Caulobacterales(16)
• Caulobacteraceae(16)
• Brevundimonas(5)
• Caulobacter(8)
• Phenylobacterium(3)
• Rhizobiales(135)
• Aurantimonadaceae(4)
• Aurantimonas(2)
• Fulvimarina(2)
• Bradyrhizobiaceae(38)
• Bradyrhizobium(9)
• Nitrobacter(8)
• Oligotropha(3)
• Rhodopseudomonas(18)
• Brucellaceae(43)
• Brucella(28)
• Ochrobactrum(15)
• Methylobacteriaceae(12)
• Methylobacterium(12)
• Phyllobacteriaceae(11)
• Hoeflea(2)
• Mesorhizobium(6)
• Parvibaculum(3)
• Rhizobiaceae(23)
• Agrobacterium(15)
• Rhizobium(2)
• Sinorhizobium(6)
• Xanthobacteraceae(4)
• Azorhizobium(2)
• Xanthobacter(2)
• Rhodobacterales(22)
• Hyphomonadaceae(2)
• Oceanicaulis(2)
• Rhodobacteraceae(20)
• Labrenzia(2)
• Oceanibulbus(2)
• Pannonibacter(2)
• Paracoccus(3)
• Rhodobacter(9)
• Roseovarius(2)
• Rhodospirillales(13)
• Acetobacteraceae(3)
• Acetobacter(3)
• Rhodospirillaceae(10)
• Magnetospirillum(7)
• Rhodospirillum(3)
• Sphingomonadales(14)
• Sphingomonadaceae(14)
• Novosphingobium(3)
• Sphingomonas(5)
• Sphingopyxis(3)
• Zymomonas(3)
• uncultured alpha proteobacterium(1)
• Betaproteobacteria(1062)
• Burkholderiales(665)
• Alcaligenaceae(66)
• Achromobacter(28)
• Alcaligenes(6)
• Bordetella(31)
• Oligella(1)
• Burkholderiaceae(550)
• Burkholderia(506)
• Cupriavidus(17)
• Polynucleobacter(5)
• Ralstonia(22)
• Comamonadaceae(32)
• Acidovorax(7)
• Comamonas(4)
• Delftia(4)
• Diaphorobacter(2)
• Polaromonas(6)
• Rhodoferax(3)
• Variovorax(3)
• Verminephrobacter(3)
• Leptothrix(2)
• Methylibium(3)
• Oxalobacteraceae(12)
• Herminiimonas(3)
• Janthinobacterium(3)
• Oxalobacter(6)
• Hydrogenophilales(1)
• Hydrogenophilaceae(1)
• Thiobacillus(1)
• Methylophilales(8)
• Methylophilaceae(6)
• Methylobacillus(6)
• Methylophilales bacterium HTCC2181(2)
• Neisseriales(365)
• Neisseriaceae(365)
• Chromobacterium(1)
• Eikenella(2)
• Laribacter(5)
• Lutiella(2)
• Neisseria(355)
• Nitrosomonadales(6)
• Nitrosomonadaceae(6)
• Nitrosomonas(5)
• Nitrosospira(1)
• Rhodocyclales(15)
• Rhodocyclaceae(15)
• Aromatoleum(3)
• Azoarcus(5)
• Dechloromonas(5)
• Thauera(2)
• beta proteobacterium KB13(2)
• Deltaproteobacteria(45)
• Bdellovibrionales(2)
• Bdellovibrionaceae(2)
• Bdellovibrio(2)
• Desulfobacterales(3)
• Desulfobulbaceae(3)
• Desulfotalea(3)
• Desulfovibrionales(29)
• Desulfohalobiaceae(2)
• Desulfohalobium(2)
• Desulfomicrobiaceae(2)
• Desulfomicrobium(2)
• Desulfovibrionaceae(25)
• Desulfovibrio(20)
• Lawsonia(5)
• Desulfuromonadales(6)
• Geobacteraceae(6)
• Geobacter(6)
• Myxococcales(3)
• Polyangiaceae(3)
• Sorangium(3)
• Syntrophobacterales(2)
• Syntrophaceae(2)
• Syntrophus(2)
• Epsilonproteobacteria(99)
• Campylobacterales(97)
• Campylobacteraceae(86)
• Campylobacter(84)
• Sulfurospirillum(2)
• Helicobacteraceae(11)
• Helicobacter(8)
• Wolinella(3)
• Nautiliales(2)
• Nautiliaceae(2)
• Caminibacter(2)
• Gammaproteobacteria(11358)
• Aeromonadales(192)
• Aeromonadaceae(192)
• Aeromonas(192)
• Alteromonadales(20)
• Alteromonadaceae(1)
• Alteromonas(1)
• Pseudoalteromonadaceae(3)
• Pseudoalteromonas(3)
• Shewanellaceae(16)
• Shewanella(16)
• Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)(3)
• Chromatiales(2)
• Halothiobacillaceae(2)
• Halothiobacillus(2)
• Enterobacteriales(8790)
• Enterobacteriaceae(8790)
• Buchnera(20)
• Candidatus Blochmannia(3)
• Citrobacter(202)
• Cronobacter(6)
• Edwardsiella(10)
• Enterobacter(341)
• Erwinia(13)
• Escherichia(3912)
• Hafnia(13)
• Klebsiella(1204)
• Kluyvera(34)
• Morganella(28)
• Pantoea(5)
• Pectobacterium(9)
• Photorhabdus(6)
• Proteus(110)
• Providencia(22)
• Raoultella(15)
• Salmonella(1860)
• Serratia(114)
• Shigella(494)
• Sodalis(5)
• Yersinia(364)
• Methylococcales(3)
• Methylococcaceae(3)
• Methylococcus(3)
• Pasteurellales(238)
• Pasteurellaceae(238)
• Actinobacillus(86)
• Avibacterium(6)
• Bibersteinia(7)
• Haemophilus(64)
• Histophilus(2)
• Mannheimia(28)
• Pasteurella(43)
• Pasteurella aerogenes(2)
• Pseudomonadales(1629)
• Moraxellaceae(442)
• Acinetobacter(422)
• Moraxella(1)
• Psychrobacter(19)
• Pseudomonadaceae(1187)
• Azotobacter(4)
• Pseudomonas(1183)
• Thiotrichales(5)
• Francisellaceae(2)
• Francisella(2)
• Piscirickettsiaceae(3)
• Thiomicrospira(3)
• Vibrionales(355)
• Vibrionaceae(351)
• Aliivibrio(3)
• Listonella(4)
• Photobacterium(32)
• Vibrio(312)
• Vibrionales bacterium SWAT-3(4)
• Xanthomonadales(119)
• Xanthomonadaceae(119)
• Stenotrophomonas(113)
• Xanthomonas(6)
• marine psychrotrophic bacterium Mst37(1)
• marine psychrotrophic bacterium MstK25(1)
• Pseudomonas sp.(3)
• Zetaproteobacteria(2)
• Mariprofundales(2)
• Mariprofundaceae(2)
• Mariprofundus(2)
• Streptophyta(10)
• Liliopsida(4)
• Poales(4)
• Poaceae(4)
• Hordeum(1)
• Zea(3)
• Malpighiales(6)
• Tenericutes(5)
• Mollicutes(5)
• Mollicutes bacterium D7(2)
• Mycoplasmatales(3)
• Mycoplasmataceae(3)
• Mycoplasma(1)
• Ureaplasma(2)